Alternate Directory ist eine System-Cleaner-Anwendung, die auf Wunsch unnötige Dateien unter anderem anhand ihres Dateiformats von den Festplatten von Windows-Systemes entfernt. Dabei hat der User neben der Auswahl aus drei Reinigungsintensitäten verschiedene weitere Optionen: So kann er beispielsweise die zur Entsorgung ausgesuchten Files zunächst in den Papierkorb transportieren oder hat freie Wahl bezüglich der zu durchsuchenden Laufwerke.