Ein beschädigtes Dateisystem kann unter Windows zu Fehlermeldungen, Zugriffsproblemen und Ausfällen führen. Weniger bekannt ist, dass NTFS kleinere Fehler selbstständig im laufenden Betrieb beheben kann. Administratoren können mit dem Bordmittel fsutil prüfen, ob diese Selbstheilung aktiviert ist, und vorhandene Fehlerprotokolle einsehen. Für eine weitergehende Kontrolle steht außerdem chkdsk bereit.